[albert52]

Продолжим.

Микросателлиты помимо кодирующих областей генов также менее распространены в эволюционно консервативных геномных областях, таких как CpG-островки и сайты связывания факторов транскрипции и более стабильны. Возникновение MSI может серьезно повлиять на фенотип из-за нарушений или потери функции белка. Так, предположено, что частота микросателлитов в кодирующих областях минимизирована давлением отбора против мутаций рамки считывания, а некодирующие области, такие как интроны, внутригенные области и сайты сплайсинга, имеют значительно больше микросателлитов. При этом микросателлитные локусы в интронах и других нетранслируемых областях играют роль в модуляции экспрессии генов, влияя на транскрипцию и сплайсинг генов.
Общая точка зрения на наследование частоты MSI состоит в том, что длина повторов и состав микросателлитов в определенных локусах пропорциональны их частотам.

Oбщее количество митозов, которые стволовые клетки осуществляют в определенной ткани, положительно коррелирует с пожизненным риском развития рака. При этом количество мутаций, обнаруженных в каждой опухоли, сильно отличается не только от количества, обнаруженного в нормальных клетках, но и между различными типами опухолей, в диапазоне от 500 до 100000 мутаций.

Поскольку они отвечают за коррекцию мутационной перегрузки, гены MMR приобрели роль генов-супрессоров опухолей. При спорадических ненаследственных формах рака MSI является следствием либо инактивирующих мутаций в одном из генов MMR, либо эпигенетических механизмов репрессии гена MMR, включая подавление регуляции микроРНК. Сравнительное исследование miRNAs, участвующих в колоректальном раке, показало, что снижение уровней miR-552, miR-592, miR-181c и miR-196b наблюдалось в опухолях с развитой MMR по сравнению с повышенными уровнями miR-625 и miR-31 в опухоли с дефицитом MMR.

Неисправность белков MMR из-за мутации или снижения экспрессии предполагает корреляцию развития рака с аберрациями всех или большинства белков MMR. MSI-H: 31,37% карциномы тела матки эндометрия, 19,72% аденокарциномы толстой кишки; 19,09% аденокарциномы желудка, 5,73% аденокарциномы прямой кишки.
В случае колоректального рака дефицит MMR может возникать как совершенно спорадический процесс из-за аберрантного гиперметилирования MLH1 в опухоли, обычно связанного с мутацией BRAF V600E. Дефицит MMR чаще всего проявляется как спорадический (ненаследственный) процесс, характеризующийся отчетливой гиперпролиферативной, зубчатой ​​морфологией, аномалиями метилирования ДНК, включая CIMP, и повышенной частотой активирующих мутаций BRAF.

Основная специфичность опухолей MSI-H - увеличение количества микросателлитных аллелей вместе с общим количеством нестабильных микросателлитных локусов. Пациенты, которым отнесено более высокое общее бремя MSI и которым поставлен диагноз MSI-H, демонстрируют тенденцию к более длительной выживаемости. Это можно объяснить иммунотерапевтическим ответом, который происходит при раке с повышенной частотой мутаций. Раковые клетки, которые часто встречаются в общем потенциале MSI, транслируют большее количество мутировавших и усеченных белков всех видов, что приводит к пробуждению иммунной системы, которая замедляет прогрессирование опухоли. Кстати, поэтому удаление первичной опухоли может создать благоприятные условия для развития метастазов в менее иммуногенной метастатической нише (см. выше).
Дефектный MMR (dMMR) в сочетании с MSI стал важным биомаркером, который может помочь в решении, является ли конкретный тип рака хорошим кандидатом для иммунотерапии контрольных точек.

При раке насчитывают от 87 до 9032 нестабильных микросателлитов, причем среднее количество нестабильных микросателлитных локусов значительно варьирует. Рак толстой кишки показывает самое большое количество локусов MSI. Нестабильные микросателлиты обнаруживаются внутри или в непосредственной близости от генов, уже известных своим онкогенным потенциалом. Таким образом, нестабильные микросателлиты могут быть полезны для распознавания новых генов-кандидатов, вызывающих рак.
Кроме того, профили MSI по отдельным микросателлитным локусам помогают их группировать. Так, присутствие MSI в опухолях астроцитом с использованием полиморфных микросателлитных маркеров для генов DVL показало, что MSI присутствует в 28,6% пилоцитарных, 61,5% диффузных, 45,5% анапластических астроцитом и в 34,3% глиобластом, что еще раз демонстрирует относительно постоянное присутствие MSI на разных степенях астроцитом.

Ранние колоректальные аденомы демонстрируют маркеры иммунореактивности даже при отсутствии высокой соматической мутации или неоантигенной нагрузки. По мере прогрессирования поражений до прогрессирующих аденом и карцином наблюдается соответствующий рост количества мутаций/ неоантигенов и маркеров иммунной толерантности.
Опухоли с дефицитом MMR часто демонстрируют высокую мутационную нагрузку и могут экспрессировать неоантигены, генерируемые мутациями сдвига рамки считывания в кодирующих микросателлитах. Неоантигены будут вызывать активное иммунное микроокружение и повышать иммуногенность опухоли.

Инфильтрирующих лимфоцитов больше при колоректальном раке с дефицитом MMR, сопровождающимся сверхэкспрессией воспалительных цитокинов. Более того, было продемонстрировано, что несколько контрольных точек, включая PD-L1 и CTLA4, были активированы при колоректальном раке. Универсальный биомаркер - мутационная нагрузка опухоли (TMB) оказался полезным для прогнозирования ответа на иммунотерапию на различные типы применяемых иммунотерапевтических средств. Высокая нагрузку опухолевых мутаций (TMB) обычно определяется как более 10 мутаций на мегабазу (Mb).

Каждая стратегия лечения нуждается в целенаправленном пересмотре рисков и преимуществ. Например, хотя антитела анти-PD-1/PD-L1 могут усилить иммунный надзор, они также связаны со значительной частотой тяжелых нежелательных явлений. К ним относятся иммуноопосредованные легочные, печеночные, кожные, неврологические, желудочно-кишечные и эндокринные токсические эффекты, некоторые из которых приводят к летальному исходу. Ингибиторы PD-1/PD-L1 также не имеют четкой реакции на дозу, что делает проблематичным назначение более низких доз этих препаратов для профилактики рака.

При синдроме Линча распространенность предраковых состояний (особенно аденом) зависит от возраста и генной мутации и кол***ется от 10,6% до 33%, но только около 50% этих аденом демонстрируют дефицит MMR, остальные связаны с CIN. Напротив, у ниъ гистологически нормальные крипты с дефицитом MMR относительно многочисленны в слизистой оболочке здоровых пациентов, что означает, что значительное количество MMR-дефицитных крипт подвергается «иммуноредактированию» до трансформации в аденомы.
Иммуноредактирование — это процесс, при котором аномальный рост клеток останавливается и регрессирует с помощью Т-клеточного иммунитета. В случаях, когда поражение не полностью искоренено, за иммуноредактированием следуют фазы равновесия и, в конечном итоге, фазы ускользания от иммунного ответа, когда оставшиеся клетки способны уклоняться от обнаружения иммунной системой.

Кстати, у пациентов с синдромом Линча нестабильность кодирующих и некодирующих микросателлитов дает надежную сигнатуру неоантигенов, специфичных для опухоли/ткани, на которые могут быть нацелены предварительно разработанные библиотеки вакцин. Сейчас ранняя фаза клинических испытаний с использованием пептидов, идентифицированных как иммуногенные.